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近日,中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室包振民院士和王师教授团队在国际生物信息数据库领域知名期刊《核酸研究》发表论文,发布了面向全球格局的海洋微生物综合多组学资源数据库——Ocean-M。
/ Y3 W% @1 x6 ?4 u4 H 随着海洋微生物多维度组学数据的快速增长,全球海洋微生物学研究正面临前所未有的数据整合与深度分析挑战。现有数据库多以数据资源存储和分析工具为主,缺乏对多源异构数据的系统挖掘与深度解析,如何实现复杂、高维、海量的海洋微生物数据的系统整合,实现从“单一物种”到“多维生态位”的全面深度解析仍是亟待突破的难题。为应对这一挑战,研究团队开发了Ocean-M平台,构建了全球海洋微生物多组学综合资源数据库Ocean-M,打破了传统数据库的局限,形成了“组学资源—生态互作—功能挖掘”一体化深度研究平台。 y$ s1 A+ ^ s! h. M
Ocean-M数据库整合了全球多生境、多尺度的海洋微生物多组学数据,成为海洋微生物研究领域最全面的开放获取数据库。平台汇集了来自全球不同海洋生态系统的57000余个微生物数据,涵盖宏基因组、宏转录组、宏蛋白质组、宏代谢组等多个层次,样本涵盖了从极地到赤道、从表层到深海的完整生态梯度。该数据库不仅为海洋微生物学、生态学等基础科学研究提供了强大的数据支持,还为海洋生物资源开发和生物技术创新等领域提供了宝贵的数据资源。
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